Ia memulai karier sepak bolanya dengan bergabung ke akademi sepak bola di ASIOP Apacinti pada 2006 silam.

Aji Santodo International Football Academy (ASIFA) juga pernah menjadi tempatnya mengembangkan skill.

Pada 2016, Muhammad Rafli pernah mengarungi pertandingan sepak bola bersama Bhayangkara U-20.

Kemudian, penggawa berpostur 1,80 meter itu memulai karier profesionalnya dengan bergabung bersama Arema FC pada Liga 1 2017.

Sampai saat ini hingga 2025 mendatang, Muhammad Rafli diketahui masih memiliki kontrak untuk memperkuat klub Singo Edan itu.

Biodata Muhammad Rafli

Nama                                                         : Muhammad Rafli

Tempat lahir                                             : Tangerang, Banten, Indonesia

Tanggal lahir                                             : 24 November 1998 (25 tahun)

Kewarganegaraan                                   : Indonesia

Tinggi                                                         : 1,80 meter

Posisi                                                         : Gel. Serang

Kaki dominan                                           : Keduanya

Klub saat ini                                             : Arema FC

Bergabung                                                : 1 Januari 2017